Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms