Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms