Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms