Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREMQ03060 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREMQ03060 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREMQ03060 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREMQ03060 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREMQ03060 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREMQ03060 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREMQ03060 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREMQ03060 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREMQ03060 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREMQ03060 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CREMQ03060 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREMQ03060 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms