Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms