Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms