Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms