Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms