Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms