Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms