Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms