Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFC1P60507 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms