Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HK3P52790 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HK3P52790 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HK3P52790 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HK3P52790 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HK3P52790 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HK3P52790 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HK3P52790 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HK3P52790 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HK3P52790 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HK3P52790 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HK3P52790 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HK3P52790 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HK3P52790 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HK3P52790 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HK3P52790 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HK3P52790 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HK3P52790 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HK3P52790 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HK3P52790 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HK3P52790 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms