Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RAB5CP51148 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RAB5CP51148 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RAB5CP51148 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RAB5CP51148 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RAB5CP51148 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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RAB5CP51148 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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