Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPOP42166 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPOP42166 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms