Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms