Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms