Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA3P29320 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms