Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HTR2AP28223 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HTR2AP28223 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms