Protein–RNA interactions for Protein: P28069

POU1F1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU1F1P28069 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU1F1P28069 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU1F1P28069 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU1F1P28069 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU1F1P28069 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU1F1P28069 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms