Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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APCP25054 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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APCP25054 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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APCP25054 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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APCP25054 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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APCP25054 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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APCP25054 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APCP25054 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APCP25054 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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APCP25054 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APCP25054 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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APCP25054 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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APCP25054 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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APCP25054 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APCP25054 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APCP25054 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
APCP25054 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
APCP25054 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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APCP25054 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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APCP25054 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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APCP25054 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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APCP25054 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
APCP25054 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APCP25054 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APCP25054 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APCP25054 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APCP25054 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APCP25054 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APCP25054 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APCP25054 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APCP25054 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
APCP25054 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APCP25054 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
APCP25054 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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