Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms