Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA1P23193 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms