Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRHP20396 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRHP20396 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRHP20396 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRHP20396 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRHP20396 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRHP20396 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRHP20396 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRHP20396 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRHP20396 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRHP20396 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRHP20396 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRHP20396 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRHP20396 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRHP20396 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRHP20396 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRHP20396 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRHP20396 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRHP20396 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms