Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms