Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms