Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
XBP1P17861 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XBP1P17861 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XBP1P17861 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms