Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms