Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms