Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms