Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms