Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINA1P01009 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms