Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX6O95503 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX6O95503 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX6O95503 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX6O95503 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX6O95503 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX6O95503 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX6O95503 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms