Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIOO75962 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIOO75962 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIOO75962 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIOO75962 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIOO75962 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIOO75962 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIOO75962 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIOO75962 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIOO75962 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIOO75962 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIOO75962 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIOO75962 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIOO75962 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIOO75962 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIOO75962 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIOO75962 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIOO75962 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIOO75962 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIOO75962 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIOO75962 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIOO75962 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIOO75962 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIOO75962 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIOO75962 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIOO75962 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIOO75962 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIOO75962 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIOO75962 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIOO75962 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIOO75962 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIOO75962 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIOO75962 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIOO75962 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIOO75962 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIOO75962 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIOO75962 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIOO75962 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms