Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSVO60911 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSVO60911 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms