Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms