Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SYNGR3O43761 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms