Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC8O43402 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms