Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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HOXC11O43248 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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HOXC11O43248 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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HOXC11O43248 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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HOXC11O43248 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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HOXC11O43248 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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HOXC11O43248 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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HOXC11O43248 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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HOXC11O43248 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC11O43248 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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