Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CROCC2H7BZ55 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CROCC2H7BZ55 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CROCC2H7BZ55 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CROCC2H7BZ55 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CROCC2H7BZ55 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CROCC2H7BZ55 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms