Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms