Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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SOBPA7XYQ1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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