Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms