Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms