Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms