Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms