Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCDHA12Q9UN75 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms