Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms