Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC24A2Q9UI40 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms