Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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